20世纪末一个初冬夜晚，不计其数的奇异卡片突然从阴霾的天空落下，散布到世界各地。没人知道它们从何而来，作用何在。一年后，一个世界闻名的冒险家、考古学家向世界，他掌握能将卡片变成巨兽的咒语，并能操纵它们战斗。随着幻兽的 出现，人类社会的平衡秩序被打破。政府为了改变混乱局面，组织了两年一届的世界御兽师争霸赛。故事的主角——祺翔十分羡慕御兽师这种职业，机缘巧合得到一只幻兽momo，之后和朋友玄福，希茹，以及化敌为友的朋特，开始了他们圆梦御兽师的旅程，他们经过一系列比赛的磨练，克服了种种困难，一步一步向梦想靠近，
